對于生物制藥車間而言，如何控制潔凈室內的污染源永遠是最重要的核心問題，而對于生物制藥而言，如何防止細菌滋生，提高藥品的成品率更是重中之重。而對于制藥車間來說，也是從如何降低潔凈室的污染值開始，而對于制藥車間內的主要污染源不止是來自于人員本身，新型的建筑裝飾材料、粘結劑、清潔劑等物品同樣是潔凈室內的污染源之一，所以選用綠色環保材料是降低制藥車間污染值最好的方法，同時也是減少新風負荷，降低能耗很好的途徑。

如何設計好生物制藥車間才能將能耗降到最低？首先我們應當在潔凈車間設計時，就考慮到生產設備的大小、操作方式、維護維修、設備清洗和生產能力等因素，潔凈室的凈化級別必須按照生產的要求來確定，比如生物制藥車間中對注射劑稀配間要求較高，需用萬級潔凈室，而濃配間卻對環境要求不高，只需要讓潔凈車間達到十萬級即可。

其次是對生物制藥中潔凈度要求高的凈化車間應當使用局部凈化措施，比如制藥車間中的大輸液的灌封需要在萬級潔凈室且局部百級的生產環境內操作。那我們在設計該潔凈車間時就無需做到全百級，只需局部做到百級凈化級別即可。

制藥車間凈化工程不僅可以在潔凈室的凈化級別上做到節能，還可以從溫濕度等參數上做出調整。根據GMP流程規定，制藥車間最適宜的生產環境溫度在18℃～26℃，而相對濕度在45%～65%，但其實真正在藥品生產的過程中，只有部分工藝是對溫濕度有具體的要求的，當然溫濕度的要求還得讓操作人員有著一定的舒適感，不然不適的操作環境也會影響生產效率。